#NEXUS

[Aphragmeae alignment, status checked Jan 09 2018]
[ITS-1: 1-247, 5.8S rDNA: 248-411, ITS-2: 412-590]


BEGIN DATA;
DIMENSIONS NTAX=10 NCHAR=590;
FORMAT DATATYPE=DNA GAP=- MISSING=? ;

MATRIX
Aphragmus_eschscholtzianus_DQ165334       ACTCTCGGTGGGCCGGTTTCT--TAGCTGATCCCGTGACTGCCGATTCCGTGGTTTCGCGTA-TGTTCCCCTCAAGAGAGTTTTTC---TCGGTCGG-------------------GTCACACGCGTAGCTTCTGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATAGAACTAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGTGTGCGTATGCTGTGCTGCAATCTTAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCT--CCATCC---CATGCGGATACGGGACGGAAGATGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCCGAGCCAGGGACGCCACGAGTGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTCTTCATAACGTCGGTCACTCTTGTCCAG---AAGCTCTAGATG
Aphragmus_involucratus_FM164512_FM164513  ACTATCGGCGGGCCGGTTTCT--TTGTTGATCCCGTGCCTGCTGATTCCGTGGTTTCGTGTA-TGCTCCCTTCAAGAGATTTTTTC---TCGGTCGG-------------------GTCATGCGCGGAGCTTCCGGATCTCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATGGAACAAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGTGTGCGTATGCTGTGCTGCAATCTTAAGTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTCGTCCCT--CCATCC---CTTGCGGATACGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCTGAGCCAAGGACGCCACGAGTGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTTTTCGTAACGTCATTCACTCTTGTCCGG---AAGCTCGAGATG
Aphragmus_nepalensis_DQ165335             ACTCTCGGTGGGCCGGTTTCT--TAGCTGATCCCGTGACTGCCGATTCCGTGGTTTTGCGTA-TGTTCCCCTCAAGAGATTTTTTC---TCGGTCGG-------------------GTCATACGCGTAGCTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATAGAACTAAACAGCTTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGTGTGCGTATGCTATGCTGCAATCTTAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCT--CCATCC---CATGCGGATACGGGACGGAAGTTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCCGAGCCAAGGACGCCACGAGTGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTCTTCATAACGTCGGTCACTCTTGTCCAG---ATGCTCTAGATG
Aphragmus_obscurus_DQ165336               ACTCACGGTTGGCCGGTTTCT--TTGCTGATCCCGTGCCTCCCGATTCCGTGGTCTCGCGTA-TGTTCCCCTCAAGAGATATTTTC---TCTGTTGG-------------------GTCATGCGCCTGGCTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATGTAACTAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGTGTGCGTATGCTGTGCTGCAATCTTAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTTCCT--CCATAC---CATGTGGATACGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCCGAGCCAAGGACGCCATGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTATTCGTTACGTCGTTCACTCTTGTCCGG---GAGCTCTAGATG
Aphragmus_oxycarpus_DQ165337              ACTATCGGTGGGCCGGTTTCT--TTGTTGATCCCGTGCCTGCTGATTCCGTGGTTTCGTGTA-TGCTCCATCCAAGAGATTTTTTC---TCGGTCGG-------------------GTCATGCGCGGAGCTTCCGGATCTCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATGGAACAAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGTGTGCGTATGCTGTGCTGCAATCTTAAGTATAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTATGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCT--CCATCC---CATGCGGATACGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCTGAGCCAAGGACGCCACGAGTGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTTTTCGTAACGTCATTCACTCTTGTCCGG---AAGCTCGAGATG
Aphragmus_hobsonii_DQ165357               ACTCACGGTTGGCCGGTT-CT--TATCTGATCCCGTGCCTCCCGTGTCCGTGGACTCCTGTA-TGTTCCCCTCAAGAGATTTTTTC---TCTGTTGG-------------------GTCATGCGCGTAGCTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATGTAACTAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGCGTGTGTGCGAATGCTGTGCTGCAATCTTAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCT--CCATCC---CATGCGGATACGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCCGAGCCAAGGACGCCAAGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTATTCGTTTCGTCGTTCACTCTTGTCCGG---AAGCTCTAGATG
Aphragmus_ohbana_DQ165358                 ACTCACGGTTGGCCGGTT-CT--TATCTGATCCCGTGCCTCCCGTGTCCGTGGACTCCTGTA-TGTTCCCCTCAAGAGATTTTTTC---TCTGTTGG-------------------GTCATGCGCGTAGGTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATGTAACTAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGCGTGTGTGCGAATGCTGTGCTGCAATCTTAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCT--CCATCC---CATGCGGATACGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCCGAGCCAAGGACGCCAAGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTATTCGTTTCGTCGTTCACTCTTGTCCGG---AAGCTCTAGATG
Aphragmus_serpens_DQ165359                ACTCACGGTTGGCCGGTT-CT--TATCTGATCCCGTGCCTCCCGTGTCCGTGAACTCCTGTA-TGTTCCCCTCAAGAGATTTT--C---TCTGTTGG-------------------GTCATGCGCGTAGCTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAATATGTAACTAAACAGCCTGCTTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGTGTGCGAATGCTGCGCTGCAATCTTAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCT--CCATCC---CATGCGGATACGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGGTACCGCACGCGGTTGGCCGAAATCCGAGCCAAGGACGCCAAGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGA-ATAAAAGCCTATTCGTTTCGTCGTTCACTCTTGTCCGG---AAGCTCTAGATG
OUTArabidopsisthalianaAJ232900            ACTCTCGGTGGGCCGGTTTCT--TAGCCGATTCCTTGCCCGCCGGATCCGTGGTTTCGCGTA----------------------TCGGCATGATCGGGAGCTTTTATCTCGGTCTTGTCGTGCGCGTTGCTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGTCAAGGAACATGCAAACGAACGGCTGGCATTCGCCTCCCCGGAGACGGAGTGTGGGCGGATGCTGTGCTGCGAACTGAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCTCACCATCC---TTTGCTGATGCGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCTAAATCCGAGCCAAGGACGCCTGGAGCGTACCGACATGCGGTGGTGA-ACTTGATCCATTACATTTTATCGGTCGCTCTTGTCCGG---AAGCTGTAGATG
OUTClausiaapricaDQ357529                  ACTCTCGGCGGGCCGATTT-TCCTAGCGGATCTCGTGCCCGCCAAGTCCGTGGTTTTGCGTACTGTTCCCATGAAGAG----TTTCGGCTCGATTGG-------------------GTCATGCGCTCAGCTTCCGGATATCACAAAACCCCGGCACGAAAAGTGCCAAGGAACATGAAACTAAACAGCTTGCGTTCGCTGCCCCGGAGACGGTGTGCGTGCGGATGACAAGCTGCAATCTAAAGTCTAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCGGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCACAAATCGTCGTCCCC--CCATCCATCTTTG--GATAAGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAGNTTAGGACGTCTGGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGAAACAAAAGCCTCTTCGTTGAGTCGGTCGTTCCTGTCCGTTACGAGCTTTCGATG
;
END;


[End of File]
